Објашњено: Пет корака за откривање коронавируса (ЦОВИД-19)

Процес је за Тхе Индиан Екпресс објаснио др В Рави, виши професор и шеф Одељења за неуровирологију, НИМХАНС.

Лажна крв се види у епруветама означеним коронавирусом (ЦОВИД-19) на овој илустрацији снимљеној 17. марта 2020. (Ројтерс)

Др В Рави, виши професор и шеф Одсека за неуровирологију, НИМХАНС, објашњава процес откривања корона вируса ову веб страницу . Ево пет корака:

Сакупљање и транспорт

Центар за тестирање узима брисеве из носних шупљина и задњег дела грла (ждрела) и ставља узорке у медијум за транспорт вируса, који садржи избалансиране соли и албумин како би се спречило распадање вируса. Узорак се затим транспортује у хладно складиште у лабораторију за испитивање.

Екстракција вирусне РНК

Коронавируси као што су САРС-ЦоВ (који се појавио у Кини 2002-03), МЕРС-ЦоВ (који се појавио у Саудијској Арабији 2012) или тренутни САРС-ЦоВ-2 који је изазвао пандемију ЦОВИД-19, имају велике , једноланчани РНК геноми. Лабораторија за тестирање издваја РНК из узорака, користећи комерцијално доступне комплете (као што су они које праве компаније као што је КИАГЕН.)

Стављање РНК у ПЦР мешавину

Екстрахована РНК се додаје мешавини ланчане реакције полимеразе (ПЦР). Ово укључује „главни микс“, који садржи ензим „реверзну транскриптазу“ који претвара РНК у ДНК. Мастер микс садржи Так полимеразу, ензим који ствара копије ДНК, нуклеотиде, као и друге елементе као што је магнезијум — чији је јон потребан за амплификацију ДНК.

ПЦР мешавина такође садржи „реагенсе“ као што су „прајмери“ и „сонде“. Прајмери ​​су одређени ланци ДНК који су дизајнирани да се вежу са ДНК која се копира; сонде се користе за откривање специфичне секвенце у узорку ДНК. СЗО је препоручила специфичне прајмере и сонде за тестирање на ЦОВИД-19.

Коначно, ПЦР мешавина се састоји од гена за одржавање куће — нормалног људског гена (РНасе П) који се користи да би се осигурало да су узорци правилно прикупљени и да се РНК екстрахује.

Амплификација вирусне ДНК

Узорак, у својој ПЦР мешавини, ставља се у епрувете или плоче, које се затим стављају у термоциклер машину која се користи за спровођење ПЦР процеса.

Прво, РНК се претвара у ДНК. Тада почиње процес копирања гена. Термални циклусни уређај загрева и хлади смешу са узорком, наизменично између три температуре — за топљење ДНК да би се одвојила два ланца, да би се прајмер везао за ДНК и за синтезу новог ланца — све у једном циклусу који траје до минут. Термални циклус ради 30-40 таквих циклуса да би појачао ДНК да би проверио да ли има вируса.

Тестирање против контрола

Појачана ДНК се тестира у односу на позитивну контролу, која се обично састоји од гена вируса клонираних у плазмид, и негативне контроле, што је „познати“ узорак који је раније био негативан на вирус.

РНаза П треба да покаже појачање, позитивна контрола треба да буде позитивна, негативна контрола треба да буде негативна, а онда који год резултат добијете за узорак, то је тачан резултат, рекао је неуровиролог др В Рави. Да би тест био валидан пре објављивања резултата, морају бити испуњени одређени „критеријуми валидности“.

Не пропустите из Екплаинед | Како функционише тест на ЦОВИД-19

Ако је ген за одржавање домаћинства (РНасе П) позитиван, позитивна контрола позитивна, негативна контрола негативна и узорак не показује никакав ПЦР позитиван резултат, узорак се проглашава негативним на РНК вируса САРС-ЦоВ-2. Ако је ПЦР резултат позитиван, пацијент има ЦОВИД-19.

Подели Са Пријатељима: