Објашњено: Како функционише тест на коронавирус (ЦОВИД-19).

Како ПЦР тест тражи вирус у узорцима бриса? Колико ми треба да стигнем до тамо? Колико узорака Индија тестира дневно и може ли тестирати више? Ако може, зашто се још није повећао?

Индија тренутно спроводи двостепени ПЦР у реалном времену за тестирање на САРС-ЦОВ-2. (Ројтерс)

Који је дијагностички тест за нови коронавирус који изазива ЦОВИД-19?

Тхе Индијски савет за медицинска истраживања (ИЦМР) саопштио је да су одређене лабораторије ће користити конвенционални тест ланчане реакције полимеразе (ПЦР) у реалном времену, који се спроводи на брису сакупљеном са задњег дела грла, течном узорку из доњег респираторног тракта или једноставном узорку пљувачке. Такви тестови се обично користе у откривању вируса грипа А, грипа Б и Х1Н1.

Шта је ПЦР тест?

Користи технику која ствара копије сегмента ДНК. „Полимераза“ се односи на ензиме који праве копије ДНК. „Ланчана реакција“ је начин на који се фрагменти ДНК копирају, експоненцијално – један се копира у два, два се копирају у четири, итд. Кари Мулис, амерички биохемичар који је изумео ПЦР технику, добио је Нобелову награду за хемију 1993. године.

Међутим, САРС-ЦОВ-2 је вирус направљен од РНК, који треба да се претвори у ДНК. За ово, техника укључује процес који се зове реверзна транскрипција. Ензим „реверзна транскриптаза“ претвара РНК у ДНК. Затим се праве и умножавају копије ДНК. Флуоресцентна ДНК-везујућа боја која се зове сонда показује присуство вируса. Тест такође разликује САРС-ЦОВ-2 од других вируса.

Колико дуго траје ПЦР процес?

ПЦР у реалном времену смањио је време потребно за тестирање узорака на 4,5 сата са око 6 сати раније, рекао је научник ИЦМР др Р Р Гангакхедкар. Међутим, укупно време обрта — од тренутка када су узорци прикупљени до тренутка када се извештај достави — је око 24 сата и требало би да буде краће, рекао је он.

Објашњено: Пет корака до откривања коронавируса

Како се тест ради у Индији?

Индија тренутно спроводи двостепени ПЦР у реалном времену за тестирање на САРС-ЦОВ-2, рекао је НИМХАНС виши професор и шеф неуровирологије, др В Рави. Прва фаза је дизајнирана да открије генетске елементе заједничке за људске коронавирусе који могу постојати у узорку. Друга фаза је дизајнирана да тестира специфичне гене присутне само у вирусу САРС-ЦОВ-2.

До почетка марта, почетни скрининг Тест за проверу било које врсте коронавируса урадиле су све лабораторије, али потврдни ПЦР је урадио само Национални институт за вирусологију у Пуни. Затим је НИВ Пуне пренео технологију (реагенсе потребне за потврду) у све лабораторије како не би било потребе да узорак иде све до Пуне. Ово је смањило време потребно за тестирање узорака, рекао је др Рави.

Тестирање на корона вирус: Лажна крв се види у епруветама означеним са коронавирусом (ЦОВИД-19) на овој илустрацији снимљеној 17. марта 2020. (Реутерс илустрација: Дадо РувицО

Да ли Индија тестира довољно бројева?

Индија има капацитет да тестира 10.000 узорака дневно, а тренутно тестира око 600-700. Поређења ради, Јужна Кореја, која има слично време обрта, наводно тестира до 20.000 узорака дневно, посебно користећи моделе као што су њени погони за тестирање.

Влада тврди да у овој фази није неопходно тестирати сваку особу. Земља тестира кохорту коју за сада треба да тестира, рекао је др Гангакедкар. Ако користите локализовани пренос, довољно смо тестирали. Ако верујете да постоји пренос у заједници, онда је то друго питање. Још увек нема доказа где не знамо како је индексни случај добио ову инфекцију, рекао је он.

Екпресс Екплаинед је сада на Телеграму. Кликните овде да се придружите нашем каналу (@иеекплаинед) и будите у току са најновијим

Не желимо да радимо било какво неселективно тестирање јер сада сви траже тест. Дакле, негде ћемо морати да то рационализујемо... али је такође важно да пазимо како не бисмо пропустили пренос у заједници, рекла је научница ИЦМР-а др Ниведита Гупта током брифинга за штампу прошле недеље.

Која ће бити стратегија ако дође до преношења заједнице?

ИЦМР спроводи надзор за све доказе преношења у заједници, при чему свака од 52 индијске лабораторије за тестирање тестира 20 насумичних узорака пацијената са тешком акутном респираторном инфекцијом (САРИ). Очекује се да ће „први рез“ ових тестова бити објављен у среду. ИЦМР је рекао да ће владине стратегије бити потпуно другачије, у случају да се открије случај преноса у заједници из ових тестова надзора.

Пандемија коронавируса: У болници у Њу Делхију. (ПТИ фотографија/датотека)

Постоје ли препреке за повећање тестирања?

Трошкови су потенцијална препрека, сматрају неки стручњаци. Званичници ИЦМР-а су на конференцији рекли да је цена примарног теста на ЦОВИД-19 1.500 Рс. Ако треба да се уради други тест да би се потврдили резултати првог теста, укупан трошак је око 5.000 Рс. Један од званичника је такође рекао да су коришћене сонде, које су увезене из Немачке, ограничавајући фактор.

Док је повећан број центара за тестирање, повећан је и увоз сонди. Прошле недеље Индија је желела да увезе око 200.000 сонди, док је у понедељак др Гангакедкар рекао да влада планира да увезе око милион.

Пандемија коронавируса: кога тестирати и кога

Да ли би Индија могла да ради другачије?

Оно што је Индија почела да ради је управо оно што је препоручено за земљу у коју је болест увезена, рекао је извршни директор индијског института за транслациону здравствену науку и технологију, др Гагандип Канг. Међутим, тестирање и праћење оних који долазе у земљу, као и стављање под надзор оних са којима су били у контакту, је рационалан и одговарајући приступ ако је једини ризик био уношење болести, а праћење и тестирање је било 100 %, рекла је.

Али оно што се може десити је да са овом инфекцијом можете да се изгубите чак и пре него што развијете симптоме, а код врло малог броја можда никада нећете имати симптоме, тако да бисте је могли пренети другим људима, а да не знате да сте заражени, рекла је она. Ова врста сложености… чини неопходним да размислите о резервној стратегији да видите да ли сте заиста нешто пропустили, рекла је. Има још тога што бисмо могли да урадимо.

Да ли ће ИЦМР надзор помоћи?

Одлука ИЦМР-а је добар корак, али постоје региони које би таква вежба онда изоставила, рекао је др Канг. Ако сваке недеље тестирате узорке из сваке лабораторије за грип, онда ако нађете чак и један позитиван, то ће вам рећи да сте много пропустили, рекла је.

Према др Кангу, могуће је користити математичко моделирање да би се разумело шта би влади дало разумну шансу да идентификује да ли већ постоји било какав пренос у заједници. Мислим да би било сјајно имати модел какав има Сингапур, где је сваком лекару било где који је имао клиничку сумњу, чак и ако се не уклапа у опис, било дозвољено да пошаље свог пацијента на тест, додала је она.

– Уноси Шерифа Каунаина М

Подели Са Пријатељима: