Објашњено: Које су варијанте Цовид-19 у Индији и да ли оне објашњавају пораст?

Утврђено је да преко 320 узорака коронавируса имају британску лозу у Пенџабу. Да ли ово објашњава недавни пораст? А колико су распрострањене јужноафричке и бразилске варијанте, поред осталих у Индији?

У тржном центру у Пуни (Експрес фото: Ашиш Кале, датотека)

Утврђено је да има више од 320 узорака коронавируса из Пенџаба лоза УК , референца на нови сој вируса који се појавио у Великој Британији у децембру, са генетским мутацијама које су му омогућиле да се брже шири. Ово је најраспрострањенија појава варијанте у Великој Британији у индијској популацији која је до данас пронађена и могла би објаснити брз пораст случајева у Пенџабу у последњих неколико недеља.

билтен| Кликните да бисте добили најбоља објашњења дана у пријемном сандучету

У саопштењу владе у среду се наводи да је до сада утврђено да је 736 узорака из целе земље пореклом из Велике Британије. Осим ових, утврђено је да 34 узорка имају јужноафричку лозу, а један бразилску. Јужноафричка и бразилска варијанта су још два доминантна соја коронавируса који круже широм света. Генетске мутације у ове две варијанте чине да је већа вероватноћа да ће избећи људски имуни систем. Према томе, постоји бојазан да би постојеће вакцине могле бити релативно мање ефикасне против њих, иако се то још увек истражује.

Варијанте у Индији

Британска, бразилска и јужноафричка варијанта нису једине које тренутно круже у индијској популацији. Као и сваки други организам, вирус корона такође стално мутира, а неке промене у његовој генетској структури се дешавају у сваком циклусу репликације. Већина ових мутација је безначајна и не мења општу природу или понашање коронавируса. Али неколико њих, вероватно један у хиљадама, може да уведе важне промене, помажући вирусу да се прилагоди или боље преживи.

Током ове епидемије помно се прате три врсте промена — оне које повећавају способност вируса да се брже шири, оне које изазивају тежу болест код заражене особе и оне које помажу вирусу да избегне имуни одговор.

Британска, бразилска и јужноафричка варијанта су такве врсте. Сваки од њих сада има своје породице, што значи да је било много каснијих мутација у њима, али са оригиналном дефиницијом мутације која је остала нетакнута. Ове три варијанте породице, или лозе, пронађене су у више земаља и углавном су одговорне за пораст случајева у Европи и Бразилу.

Поред ових, у индијској популацији кружи још неколико варијанти, оних које имају настала локално као и друге које су донели путници из иностранства. Али ништа од овога није класификовано као варијанта забринутости.

Варијанте Цовид-19 откривене у Индији

Британска варијанта Цовид-19 и забринутости

Научници су тврдили да се ниједна од три „варијанте забринутости“ – УК, Бразил или Јужноафричка – не може повезати са тренутним порастом случајева у Индији. Њихов ниво распрострањености у заједници, за сада, није толико висок да би се тренутни пораст могао приписати њима.

Чак иу Пенџабу, где се показало да је 80% од 400 анализираних узорака варијанта из Велике Британије, прерано је кривити је за изузетан пораст случајева у последњих неколико недеља. Резултати секвенцирања генома су сада откривени и потребно је урадити клиничку корелацију да би се проценило да ли су они одговорни за пораст случајева.

Како су научници истакли, ако су људи заражени британским сојем у Пенџабу сви путници или њихови директни контакти, онда би се њихове појаве могле лако објаснити и не представљају превелику бригу. Међутим, ако се нађе и код људи у широј заједници, онда постоји опасност да се врло брзо прошири и на друге. То би такође значило да се процедуре изолације и карантина које се поштују у држави, посебно за путнике, нису стриктно поштовале.

Неколико специфичних мутација пронађених у УК соју, попут једне под називом Е484К и друге под називом Н440К, виђене су и у неким другим варијантама, а оне круже у индијској популацији већ неколико месеци. Тренутно нема доказа који би указивали на то да је било који од њих могао довести до другог пораста или изазвати поновну инфекцију код пацијената.

Међутим, потребна су много детаљнија научна истраживања да би се проценио њихов утицај на ширење болести у Индији.

Секвенцирање генома…

Индија има други највећи број људи заражених коронавирусом током епидемије. Али урадио је врло мало секвенци генома различитих варијанти у циркулацији. До сада је извршила анализу гена за 19.092 узорка из целе земље, наводи се у саопштењу владе у Парламенту прошле недеље. Ово укључује секвенцирање 10.787 узорака од када је влада у децембру основала ИНСАЦОГ (индијски САРС-ЦоВ2 конзорцијум за геномику) посебно за ову сврху. Многе друге земље, укључујући Сједињене Државе и Кину, анализирале су више од 100.000 генских секвенци.

Проучавање генетских промена у организму важан је траг за разумевање порекла, преноса и утицаја вируса на пацијенте. Наведени циљ ИНСАЦОГ-а је да кроз мрежу од десет лабораторија секвенцира узорке из најмање 5% свих заражених. То тренутно изгледа као веома тежак задатак. Индија је до сада забележила преко 1,17 милиона позитивних случајева. 19.092 узорка који су до сада секвенционирани чине само 0,16% тог броја.

ПРИДРУЖИ СЕ САД :Експрес објаснио Телеграм канал

… и зашто је било споро

Један од главних разлога за спор темпо секвенцирања генома је недостатак средстава. До сада није додељен новац за ИНСАЦОГ, иако су званичници рекли да се одобрење за средства сада очекује сваког дана. Лабораторије су користиле новац из сопствених годишњих буџета да би обавиле посао секвенцирања. За екстракцију генске секвенце једног узорка потребно је између 3.000 и 5.000 Рс. Трошкови су углавном хемијски реагенси који су потребни у процесу.

Такође, државе нису проактивно слале своје узорке у лабораторије на секвенционирање. Махараштра, која је до сада забележила више од 25 милиона инфекција, послала је само око 2.800 узорака на секвенционирање, према владиним подацима представљеним у парламенту. То је само око 0,11% свих случајева. Керала је послала највећи број узорака на секвенционирање, око 5.200, али Карнатака, која има упоредив број случајева, послала је само 137 узорака. Овако ниска стопа секвенцирања генома можда неће бити статистички значајна да би се извукли закључци о променљивој природи и понашању вируса, или у дизајнирању одговарајућих интервенција за обуздавање ширења епидемије.

Овај чланак се први пут појавио у штампаном издању 25. марта 2021. под насловом „Крековање соја вируса“.

Подели Са Пријатељима: